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Projet Velyger (2008-2010) : Observer, Analyser et Gérer la variabilité du recrutement de l’huître creuse en France. Rapport de synthèse ArchiMer
Pouvreau, Stephane; Bernard, Ismael; Le Souchu, Pierrick; Huvet, Arnaud; Talarmain, Eric; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; Barbier, Claire; Tournaire, Marie-pierre; D'Amico, Florence; Rumebe, Myriam; Neaud-masson, Nadine; Bedier, Edouard; Martin, Anne-genevieve; Claude, Serge; Langlade, Aime; Bouget, Jean-francois; Hitier, Benoist; Stanisiere, Jean-yves; Breerette, Stephane; Robert, Stephane; Guilpain, Patrice; Seugnet, Jean-luc; Guesdon, Stephane; Soletchnik, Patrick; Le Moine, Olivier; Dumas, Franck; Quemener, Loic; Barbot, Stephane; Repecaud, Michel; Mille, Dominique; Geay, A; Bouquet, Anne-lise.
L’ostréiculture constitue la principale activité aquacole française. Cette activité de quasi-monoculture, basé sur l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, repose en grande partie sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain). Or, depuis une dizaine d'années, dans les bassins d'Arcachon et de Marennes-Oléron, principaux centres de captage français pour l’huître creuse, la collecte du naissain ou captage devient encore plus variable qu’auparavant: à des années de captage presque nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) succèdent des années où il est surabondant (par exemple les années 2003 ou 2006). En parallèle, et probablement en raison du progressif réchauffement des eaux, la reproduction de...
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00054/16489/13995.pdf
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Qualité du Milieu Marin Littoral. Synthèse Nationale de la Surveillance. Edition 2009 ArchiMer
Marchand, Michel; Amouroux, Isabelle; Bedier, Edouard; Belin, Catherine; Claisse, Didier; Durand, Gaetane; Soudant, Dominique.
Ce document constitue une synthèse nationale proposée en complément des bulletins de la surveillance publiés chaque année par les Laboratoires Environnement Ressources (LER) de l’Ifremer. Elle présente les principaux résultats obtenus jusqu’en 2008 par les différents réseaux de surveillance, réseau de contrôle microbiologique (REMI), réseau de surveillance phytoplancton et phycotoxines (REPHY), réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH) et réseau mollusques des ressources aquacoles (REMORA). Le réseau de contrôle microbiologique (REMI) permet d’évaluer les niveaux de contamination microbiologique dans les coquillages et de détecter les épisodes de contamination. Les données de surveillance permettent également d’estimer la qualité...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00014/12573/9443.pdf
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Qualité du milieu marin littoral. Synthèse nationale de la surveillance Edition 2010 ArchiMer
Marchand, Michel; Amouroux, Isabelle; Bedier, Edouard; Belin, Catherine; Claisse, Didier; Daniel, Anne; Denis, Jacques; Lampert, Luis; Le Mao, Patrick; Maisonneuve, Christine; Ropert, Michel.
L’Ifremer opère de façon coordonnée à l’échelle de l’ensemble du littoral métropolitain plusieurs réseaux de surveillance : le réseau de contrôle microbiologique (REMI), le réseau de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines (REPHY), le réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH, ex-RNO) et le réseau de surveillance benthique (REBENT). Ils sont mis en oeuvre pour répondre aux objectifs environnementaux de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE), aux obligations des Conventions régionales marines (OSPAR et Barcelone) et aux objectifs sanitaires réglementaires concernant le suivi de la salubrité des coquillages des zones de pêche et de production conchylicoles. La surveillance de la survie et de la croissance des mollusques est assurée par...
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14346/11630.pdf
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Relative importance of family, site, and field placement timing on survival, growth, and yield of hatchery-produced Pacific oyster spat (Crassostrea gigas) ArchiMer
Degremont, Lionel; Bedier, Edouard; Soletchnik, Patrick; Ropert, Michel; Huvet, Arnaud; Moal, Jeanne; Samain, Jean-francois; Boudry, Pierre.
Summer mortality has been reported in the Pacific oyster, Crassostrea gigas, for many years in different parts of the world. The causes of this phenomenon are complex. The multidisciplinary program "MOREST", coordinated by IFREMER, was initiated to understand the causes of summer mortality of Crassostrea gigas juveniles in France and to reduce its impact on oyster production. Within this program, three successive groups of bi-parental families were bred in a hatchery in 2001 and placed in the field during summer in three sites (Ronce, Riviere d'Auray, and Baie des Veys). This paper reports the relative importance of family, site and field placement timing for three characters of major importance for oyster production: survival, growth, and yield. At the...
Tipo: Text Palavras-chave: Juvenile; Crassostrea gigas; Oysters; Yield; Growth; Survival.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-1693.pdf
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Reproduction de l’huître creuse, Crassostrea gigas, en Baie de Bourgneuf : Mise en place d’un suivi en 2009 dans le cadre du projet national Velyger ArchiMer
Pouvreau, Stephane; Le Souchu, Pierrick; Breerette, Stephane; Claude, Serge; Langlade, Aime; Bouget, Jean-francois; Hitier, Benoist; Martin, Anne-genevieve; Bedier, Edouard.
Dans le cadre d’un réseau national (VELYGER), la Baie de Bourgneuf (partie Nord de la Baie) a fait l’objet en 2009 d’un suivi détaillé de la reproduction de l’huître creuse, Crassostrea gigas : gamétogenèse et ponte des adultes, abondance et développement larvaire ainsi qu’intensité et survie du captage sur collecteurs. Les résultats de ce suivi ont été mis en ligne, sous la forme de bulletin hebdomadaire, en temps quasi-réel sur le site : http://www.ifremer.fr/velyger. Il ressort, en 2009, que : (1) la gamétogenèse des huîtres s’est déroulée favorablement en permettant une ponte massive dans la première quinzaine de juillet, plus précoce mais aussi plus importante que sur des sites traditionnels (Arcachon et Marennes-Oléron) ; (2) les larves ont été...
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12273/9064.pdf
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RESCO - REseau d'Observations Conchylicoles : Campagne 2012 ArchiMer
Fleury, Elodie; Bedier, Edouard.
Le réseau d’observations conchylicoles RESCO assure, depuis 2009, le suivi de lots sentinelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas sur des sites ateliers disposés sur l'ensemble du littoral français. Leur suivi permet d'acquérir des données nationales de croissance et de mortalité, de traduire la dynamique spatio-temporelle des performances d’élevage et ainsi de participer à la compréhension des phénomènes observés. Pour ce faire, des lots sentinelles d’huîtres correspondant à différentes origines (captage ou écloserie, diploïdes ou triploïdes) et à différents stades d’élevage (naissain ou adultes 18 mois) sont déployés simultanément sur 13 sites ateliers représentant les grandes régions conchylicoles du littoral français. En parallèle des suivis de...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea gigas; Huître creuse; Mortalité; Croissance; Température; Enregistrement haute fréquence; Herpes virus; Vibrio aesturianus; Agent pathogène.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00142/25346/23429.pdf
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Réseau national de suivi des performances de l'huître creuse (Crassostrea gigas). Synthèse des résultats des stations nationales REMORA. Année 2006 ArchiMer
Bedier, Edouard; Claude, Serge; Simonne, Charlotte; D'Amico, Florence; Palvadeau, Hubert; Guilpain, Patrice; Le Gall, P; Pien, S.
En 2006, le cheptel d'origine d'huîtres adultes présentait un poids moyen individuel de 28,8g. La mise à l'eau s'est effectuée entre le 13 et le 17 mars 2006 sur les stations Manche et Atlantique et le 20 mars en Méditerranée. Au niveau national, la croissance observée en 2006 pour les adultes s'avère bonne, avec des valeurs supérieures à la moyenne en Normandie (+9,6%), en Bretagne Nord (+24,7%) et dans les Pays de la Loire (+11,7%). En revanche, les performances sont médiocres dans le bassin d'Arcachon (-13,3%). En Méditerranée, le poids atteint en décembre est plus faible que la normale (-8,5%), en raison des conditions de malaïgues qui ont prévalu sur l'étang de Thau. Sur les autres secteurs, les croissances sont moyennes. Les mortalités observées chez...
Tipo: Text Palavras-chave: Remora; Qualité; Croissance; Mortalité; Basse Normandie; Remonor; Huître creuse; Crassostrea gigas; Remora; Quality; Growth; Mortality; Normandy; Remonor; Cupped (gigas) oyster; Crassostrea gigas.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/rapport-3642.pdf
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Réseau national d'observation de la moule bleue Mytilus edulis - MYTILOBS. Campagne 2012 ArchiMer
Robert, Stephane; Bedier, Edouard.
Le réseau national d’observation de la moule bleue MYTILOBS a été mis en place en 2012 sur le littoral atlantique en réponse aux interrogations sur les mauvais résultats rencontrés sur la croissance et la qualité des moules sur bouchot, dans certaines zones de production, les trois années précédentes, notamment en 2011. Sa mise à l’eau, prévue en décembre 2011, a été repoussée au mois de mars 2012. Des cinq régions productrices de moules sur bouchot, quatre ont été retenues comme sites test. Chaque région est identifiée par une zone géographique et un lieu dit : la Bretagne Nord en baie du Mont Saint Michel par Le Vivier-sur-mer, La Bretagne Sud en baie de Vilaine par Pont Mahé, Les Pays de Loire dans le Pertuis Breton par l’Aiguillon, le Poitou-Charentes...
Tipo: Text Palavras-chave: Mytilus edulis; Moules; Bouchot; Mortalité; Croissance; Température; Phytoplancton; Réseau; Biométrie; Environnement.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00166/27720/25914.pdf
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Response to divergent selection for resistance to summer mortality in Pacific oyster spat : genetic parameters and correlated responses with subsequent survival and growth ArchiMer
Boudry, Pierre; Bedier, Edouard; Ernande, Bruno; Degremont, Lionel.
The multidisciplinary program "MOREST" aims to improve our understanding of causes of summer mortality in Crassostrea gigas juveniles in France and to reduce its impact on oyster production. As part of this program, four successive generations of families were bred between 2001 and 2005 in our research hatchery in La Tremblade. Survival and growth were recorded in the field in three sites along the French coast (Ronce, Rivière d'Auray and Baie des Veys). The first generation (44 full-sib families nested within 17 half-sib families) was tested during summer 2001 to assess to what extent genetic variability exists for spat survival. An important genetic basis was found (estimated narrow-sense heritability among sites = 0.83 ± 0.40). In contrast, lower...
Tipo: Text Palavras-chave: Survival; Growth; Genetic parameters; Summer mortality; Selection; Genetic; Crassostrea gigas; Pacific oysters.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-3458.pdf
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Ressources génétiques chez l'huître creuse Crassostrea gigas : variabilité, différenciation et adaptation aux conditions de production en Charente Maritime ArchiMer
Huvet, Arnaud; Boudry, Pierre; Baud, Jean-pierre; Nourry, Max; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre; Ledu, Christophe; Heurtebise, Serge; Cornette, Florence; Blouin, Frederic; Bedier, Edouard; Lapegue, Sylvie.
es marqueurs génétiques, particulièrement bien adaptés à ces problématiques car hypervariables, ont été mis au point récemment dans notre laboratoire en collaboration avec le laboratoire Génome et Populations de Montpellier (CNRS). Ils permettent désormais l'analyse approfondie et la discrimination fine de populations d'huîtres creuses Crassostrea gigas et de rechercher si certaines d'entre-elles n'auraient pas des caractéristiques intéressantes pour l'ostréiculture locale (croissance, résistance estivale, affinage ... ). La diffusion de telles populations auprès de la profession serait plus rapide car il s'agit de la même espèce. Selon les recommandations du CIEM, il faut effectuer une mise en quarantaine des huîtres importées (après contrôles sanitaires)...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Génétique des populations; Marqueurs génétiques; Microsatellite; Huître creuse; Crassostrea gigas.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15563/12952.pdf
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Selective breeding to improve resistance against summer mortality in the Pacific oyster Crassostrea gigas : results after 3 generations ArchiMer
Boudry, Pierre; Degremont, Lionel; Bedier, Edouard; Samain, Jean-francois.
Summer mortality of adults and juveniles has been reported in the Pacific oyster, Crassostrea gigas, for many years and in several countries. The French multidisciplinary program "Morest" aims to investigate the causes of the summer mortality in Crassostrea gigas. Within this program, we designed multi-site field experiments to assess to what extent genetic variability exists for summer mortality in French populations of C. gigas and to determine whether selective breeding could improve survival.
Tipo: Text Palavras-chave: Growth; Resistance; Selective breeding; Genetic; Crassostrea gigas; Pacific oyster; Summer mortality.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/acte-3448.pdf
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Suivi environnemental de l'estuaire de l'Aber Wrac'h dans le cadre des travaux d'extension du port de Landéda. Deux premières années d'études / juillet 2005 - septembre 2007 ArchiMer
Piriou, Jean-yves; Bedier, Edouard.
As part of the extension of the port in Landeda, an environmental monitoring program of the Aber Wrac'h estuary was commissioned by the Spatial Planning Unit of the city of Brest (BMA), the administrative body that oversees port construction. The goal of this programme was to monitor the potential impact of the construction on the nearby marine environment. Surveys were carried out from July 2005 to September 2007 and provided the following results...
Tipo: Text Palavras-chave: Biométrie; Métaux lourds; HAP; TBT; Echerichia coli; Huîtres.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/rapport-4362.pdf
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Suivi national des mortalités au stade naissain d'un lot témoin et d'un lot à survie améliorée pour Crassostrea gigas ArchiMer
Degremont, Lionel; Maurouard, Elise; Nourry, Max; Seugnet, Jean-luc; Bedier, Edouard; Fleury, Elodie; Langlade, Aime; Pernet, Fabrice; Pouvreau, Stephane; Le Souchu, Pierrick; Normand, Julien; D'Amico, Florence; Rumebe, Myriam; Cantin, Christian; Barret, Jean; Le Gall, Patrik; Baud, Jean-pierre; Cochennec-laureau, Nathalie; Gervasoni, Erika; Pelissier, Pablo.
Ce rapport présente la comparaison des mortalités de deux lots de naissains de Crassostrea gigas dans plusieurs bassins conchylicoles et déterminer le gain de survie obtenu par la sélection pour des huîtres diploïdes
Tipo: Text Palavras-chave: Mortalités; Huître creuse; Crassostrea gigas; Sélection génétique; Naissain.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00065/17644/15180.pdf
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Summer mortality in juvenile cupped oysters : response to selection in the field and in laboratory ArchiMer
Degremont, Lionel; Bedier, Edouard; Soletchnik, Patrick; Ropert, Michel; Samain, Jean-francois; Boudry, Pierre.
The French project "Morest", coordinated by IFREMER, aims to a better understanding of the causes of summer mortalities in juvenile oysters by a multidisciplinary approach. Within this program, a first generation (G1) was bred in 2001 to assess to what extent genetic variability exists for this trait in French populations. 17 half-sib families (HSF) including 44 full-sib families (FSF) were obtained in the G1, and each FSF was reared in three sites along the French coast during the summer period. Significant differences in survival were observed among HSF, clearly indicating a genetic basis for survival. Estimation of heritability for survival was very high: 0.81  0.29. In 2002, 3 "good" HSF and 3 "bad" HSF were selected on their survival...
Tipo: Text Palavras-chave: Selection; Genetic; Mortalities; Crassostrea gigas; Oyster.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3439.pdf
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Summer mortality of hatchery-produced Pacific oyster spat (Crassostrea gigas). I. Estimation of genetic parameters for survival and growth ArchiMer
Degremont, Lionel; Ernande, Bruno; Bedier, Edouard; Boudry, Pierre.
The multidisciplinary project "MOREST" aims to improve our understanding of causes of summer mortality in Crassostrea gigas juveniles in France and to reduce its impact on oyster production. As pail of the MOREST project, 43 full-sib families nested within 17 half-sib families were produced, planted out and tested in 3 sites during summer 2001 to assess to what extent genetic variability exists for this trait. A strong genetic basis was found for survival as narrow-sense heritability estimates ranged from 0.47 to 1.08, with higher values in sites where summer mortality was higher. Genetic correlations across sites were positive and very high for survival, indicating no genotype by environment interaction. In contrast, lower genetic variation was observed...
Tipo: Text Palavras-chave: Growth; Survival; Juveniles; Heritability; Crassostrea gigas.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2457.pdf
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Summer mortality of hatchery-produced Pacific oyster spat (Crassostrea gigas). II. Response to selection for survival and its influence on growth and yield ArchiMer
Degremont, Lionel; Bedier, Edouard; Boudry, Pierre.
Response to divergent selection for "high" and "low" survival during the summer period, from July to October, was investigated in juvenile (six-month-old) Pacific oysters, Crassostrea gigas, by producing two sets of progenies in 2002 (Generation 2) and three sets of progenies in 2003 (Generation 3). A strict between-family approach was used and resistance of these selected progenies to summer mortality was assessed in three sites along French coasts, to determine their response to selection and estimate realized heritability of the trait. A significant difference in survival was observed between the "high" and "low" selected groups at all sites for all sets of progenies, indicating a significant genetic component. High realized heritabilities for survival...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea gigas; Heritability; Juveniles; Summer mortality; Survival; Growth.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2009/publication-6950.pdf
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Temporal variability in the Pacific oyster spatfall along the French Coast: a new monitoring project ArchiMer
Pouvreau, Stephane; Maurer, Daniele; Auby, Isabelle; Soletchnik, Patrick; Mille, Dominique; Bernard, Ismael; Bedier, Edouard.
In France, spatfall of Pacific Oysters occurs traditionally in two shellfish area of the south west of France: the Marennes-Oléron bay and the Arcachon basin. The spat collected in both sites ensures approx. 70 % of the need of the French oysters production (the other part is produced in hatcheries). But, since ten years, recruitment have become highly variable especially in Arcachon basin. For instance, in this site, spatfall (assessed at the end of the reproductive season) can vary between 50 oysters per collector to more than 20 000 oysters per collector (Figure 1). This huge variation arise questions from oysters producers and the French National Committee for Shellfish Culture want to get some explanations of the phenomenon. It is well known that...
Tipo: Text Palavras-chave: Larvae; Reproduction; Recruitment; Spatfall; Crassostrea gigas.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/acte-4543.pdf
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The identification of genes from the oyster Crassostrea gigas that are differentially expressed between progeny exhibiting opposed susceptibility to summer mortality ArchiMer
Huvet, Arnaud; Degremont, Lionel; Labreuche, Yannick; Daniel, Jean-yves; Dubrunfaut, Thomas; Boudry, Pierre; Haure, Joel; Bedier, Edouard; Ropert, Michel; Herpin, Amaury; Cunningham, Charles; Moal, Jeanne; Samain, Jean-francois.
Summer mortality associated with juveniles of the oyster Crassostrea gigas is the result of a complex interaction between the host, pathogens and environment. Divergent selection based on summer survival have been applied to produce families with resistant and susceptible progeny. Here, we describe the use of suppression subtractive hybridization to generate 150 clones that were differentially regulated between resistant and susceptible F2 progeny. The nucleotide sequence of these 150 clones was determined. Among the 25 unique sequences that matched with the products of known genes, those putatively implicated in energy generation (12%) and immune function (16%), systems suspected to be implicated in summer mortality, were extended and analyzed by real...
Tipo: Text Palavras-chave: Selection; Gene; Genetic; Summer mortality; Crassostrea gigas; Pacific oysters.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/acte-3447.pdf
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Validation in commercial conditions of the response to selection of the European flat oyster Ostrea edulis for resistance to Bonamia ostreae ArchiMer
Bedier, Edouard; Langlade, Aime; Angeri, Stéphane; Brizard, Raphael; Nerlovic, V.; Glize, Philippe; Haffray, Philippe.
Since the outbreaks of the parasitosis with Marteilia refringens and Bonamia ostreae in the last 60's, the French production of the European flat oyster dropped from 20000 mT to less than 1500 mT currently, leaving the French shellfish farming in situation of virtually monoculture of the Pacific cupped oyster Crassostrea gigas. To sustain this traditional culture, Ifremer has developed, at the experimental level, a genetic selection for a better tolerance to Bonamia ostreae which led to an improvement of survivals. The transfer of these results to the business scale requires the control of the reproduction in hatchery and the adaptation of the cycle of production to the constraints of seedlings in deep water as practised in Brittany (France). That's why a...
Tipo: Text Palavras-chave: Selection; Genetic; Bonamia ostreae; Parasite; Ostrea edulis; Oyster.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/acte-3313.pdf
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